Vũ Khí Bí Ẩn xoay quanh cuộc phiêu lưu của hai anh em, một cậu bé và người anh trai của mình, khi họ đi từ Harlem đến vùng rừng núi gần New York. Trên hành trình, họ mang theo một chiếc cặp bí ẩn mà không hiểu rõ nguồn gốc hay sức mạnh của nó.
Khi đối mặt với những kẻ xấu trong thế giới thực, hai anh em buộc phải chiến đấu để bảo vệ bản thân. Tuy nhiên, họ sớm phát hiện ra rằng mình không chỉ phải đối mặt với nguy hiểm từ con người, mà còn phải chống lại những thế lực có khả năng siêu nhiên.
Trong hành trình sinh tồn, hai cậu bé buộc phải sử dụng đến Vũ Khí Bí Ẩn mà mình đang có. Họ phải học cách kiểm soát và sử dụng sức mạnh này để chống lại những kẻ thù đáng sợ. Với sự hỗ trợ của vũ khí bí ẩn, họ dũng cảm đương đầu với thử thách.
Hai anh em phải trải qua nhiều khó khăn và nguy hiểm, nhưng cuối cùng họ đã có thể bảo vệ được bản thân và tìm thấy ý nghĩa thực sự của tình anh em.