Tam Mục Phong Thần Truyện là câu chuyện xoay quanh Nhị Lang Thần, người phải xuống phàm trần để diệt trừ yêu quái. Ban đầu, vì thay mẹ chịu tội, Nhị Lang Thần phải trải qua kiếp nạn diệt trừ yêu quái một ngàn lần để có thể trở thành thần tiên.
Dương Tiễn, nhân vật chính, hoá thành một đứa trẻ mới sinh ra đời. Sau khi trưởng thành, cậu có được thần lực và cuối cùng cũng có thể mở và sử dụng được mắt thần để diệt trừ yêu quái. Với sự trợ giúp của mắt thần, yêu quái bị tiêu diệt và biến mất khỏi thế gian.
Tuy nhiên, Vô Vọng Tử bộc lộ bản chất thực sự của mình, tiết lộ âm mưu tạo ra yêu quái. Dương Tiễn quyết định không sợ bị phạm tội với thiên đình và giết chết Vô Vọng Tử. Kết quả là mắt thần bị phong ấn và thế gian không còn Nhị Lang Thần nữa.