Mật Mã Cá Kiếm xoay quanh một hoạt động tài chính bí mật của cơ quan DEA. Năm 1986, họ đã đóng cửa công ty Cá Kiếm giả, thu về 400 triệu đô la, và để khoản tiền này yên. Sau 15 năm, số tiền đó đã tăng lên 9,5 tỷ đô la.
Một đơn vị chống khủng bố bí mật tên là Mobile Black, do Gabriel Shear lãnh đạo, muốn chiếm lấy số tiền này để tài trợ cho chiến lược chống khủng bố của họ. Gabriel Shear là một nhân vật có khả năng lãnh đạo và có sức hút. Kế hoạch của hắn ta liên quan đến một siêu mã hóa.
Hắn ta tìm đến Stanley Jobson, một hacker bị kết án. Jobson muốn gặp lại con gái Holly nhưng không có đủ tiền để chi trả chi phí pháp lý. Gabriel đề nghị giúp Jobson lấy lại tài sản của mình nếu hắn ta đồng ý giúp hắn ta xâm nhập vào máy tính lớn của chính phủ và lấy tiền.
Câu chuyện đầy rẫy những tình huống căng thẳng và hồi hộp khi Jobson thực hiện nhiệm vụ nguy hiểm này.