Tân Long Môn Khách Sạn xoay quanh câu chuyện về Chu Hoài An, một người thuộc Cấm Vệ Quân, người không quan tâm đến những cuộc tranh đấu chính trị trong triều đình nhưng lại căm ghét sâu sắc Đông Xưởng. Anh chọn đứng về phía những người chính nghĩa và bảo vệ Anh Quan Trấn, con trai duy nhất của Lão Anh Vương, khỏi sự tấn công của Đông Xưởng.
Trong hành trình phiêu lưu đầy nguy hiểm ở các quần đảo, Chu Hoài An không chỉ nâng cao võ công mà còn trở thành một người được các thế lực ở 36 đảo kính trọng. Qua những trải nghiệm, anh nhận ra rằng mình không chỉ chiến đấu vì bản thân mà còn vì nước, vì dân, trở thành một hiệp khách thực thụ, luôn chiến đấu vì công lý và chính nghĩa.
Cùng với sự phát triển của nhân vật chính, triều đình cũng trải qua những biến động lớn. Kính Vương, người đã sử dụng những thủ đoạn tàn nhẫn để lên ngôi vua, cuối cùng đã hiểu được rằng làm vua không chỉ là việc nắm quyền mà còn là trách nhiệm. Ông quyết định minh oan cho Lão Anh Vương, bình định các cuộc nổi loạn, và dũng cảm mở cửa thương mại với các nước ngoài, khôi phục lại con đường tơ lụa trên biển và trên đất liền.